建立制藥GMP凈化車間前，我們必須了解制藥GMP凈化車間凈化污染成敗的關鍵是塵埃和微生物的控制。要合理設計換氣次數和負荷，換氣量過小達不到要求，資源浪費嚴重。
制藥GMP凈化車間以塵粒、微生物等為環境控制對象，要求空氣凈化技術，而制藥GMP車間不只是空氣凈化技術！制造合格的制藥GMP凈化車間，必須熟悉制藥工藝和流程，了解產生污染的原因和積累污染物質的地點，掌握消除污染物質的方法和評價標準。唯有這樣，才能知道，潔凈度等級并不適用于物理、化學、放射性和表面懸浮粒子的生命特性。
正因為對一般工業凈化車間與制藥GMP凈化車間的區別存在著主觀認識上的誤區，在污染控制過程中使用了不當的凈化技術，導致一些制藥企業投入資金改造制藥GMP車間，但藥品質量并未得到提高。
藥品凈化車間的前期廠房設計、施工、廠房內用于藥品生產的設備的制造、安裝、生產過程中用于藥品生產的原料、藥品的包裝材料的質量、人流物流通道的設施控制等都會對藥品質量產生影響。
工藝方面是影響藥品質量的一個重要因素，主要表現在工藝控制環節上，以下幾點值得注意：
②風道內壁清潔，風道連接嚴密，漏風率小，空氣凈化處理機組系統系統要求；
②彩板的圍護結構應牢固、嚴密，潔凈室與吊頂之間應留心空隙，應做好密封措施，確保封閉門關閉牢固；
②不讓裝飾型材和工藝管道在潔凈室形成死角，積塵；
④嚴格按照藥品GMP要求進行設計和施工，并符合藥品GMP要求的規定；
⑤采用高品質密封膠，不會造成脫落、變質等現象；
③回、排彩鋼通道不能相通，禁止排灰粉塵進入回風道；
⑦內壁焊縫完全成型后，再進行焊接工藝凈化水、注水等不銹鋼衛生管；
確保風道止回閥正常工作，消除空氣倒灌現象；
⑧排水系統、管道支架和附屬設施不產生粉塵；
確保潔凈室的壓差穩定、合格，符合生產工藝要求。
制造制藥GMP凈化車間時，必須防止車間內器具、設備的合理安裝和操作不當，造成粉塵飛揚，影響整個人工環境的潔凈度。
